もう一回インストールして、キレイな状態で使用したかったのでアンインストールを決意。
http://www.amy.hi-ho.ne.jp/tachibana/cygwin/uninstall.html
上記ページを参考に削除しました。
結構簡単で、基本は c:\cygwin を削除して、レジストリから cygwin 関連のキーを消すだけ。
regedit でレジストリの削除はドキドキするけど(笑)
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